此PowerMag? Blood DNA/RNA Isolation Kit试剂盒专门针对Thermo Scientific KingFisher? Flex 和KingFisher? Duo平台定制。 PowerMag? Blood DNA/RNA Isolation Kit 可自动化、高通量从200μl加有抗凝剂的全血中同时提取DNA、RNA。实验证明可提取新鲜全血(包括保存在市售商用保护液中的血样,详见疑难点)、袖套细胞、血浆以及冷冻血液的DNA。应用的MOBIO创新ClearMag?磁珠,可高效吸附同一个样品的DNA、RNA,较终DNA得率高,纯度高,分子量大(达到100kb)。除此以外,ClearMag?磁珠技术高可靠性地选择性不吸附常见血源PCR抑制因子,确保下游PCR、RT、PCR和*二代测序等下游应用能顺利进行。, 加入200μl新鲜全血或冷藏的血样到MOBIO的2ml深孔板(DWP)中。再加入低渗缓冲液去除红细胞。然后离心,从留下的白细胞沉淀中提取核酸。其中高离序液盐缓冲液抑制游离核酸酶,保护核酸。 将细胞裂解液与ClearMag? Beads混合,并转移到KingFisher?平台上进行余下的全自动化操作,较终用RNase-Free水将DNA和RNA同时洗脱下来。 注意:自动提取平台的试剂组分订购信息请查询官网上的KingFisher?软件操作说明书。其它开放式自动化核酸提取仪也能兼容本试剂盒。具体如何修改本说明书来满足机器要求,请联系咨询仪器供应商。 注意: ?每一份血样都是不一样的。不同的白细胞数量会影响样本的核酸提取量,而白细胞数又受采血时宿主的健康状况的影响。所以核酸得率会因样本而异。 ?丛血液中提取RNA需要特别注意的是样本的运输和保存。可以用含EDTA, ACD, CPD-A或肝素的抗凝管采集血液。采血后,要想获得高质量和得率的DNA和RNA,则需尽快进行提取(2小时内)。除非使用了PAXgene?管()或者Biomatrica RNAgard?血液系统(/rnagardblood_tube.php)保护核酸,否则要避免冻存样品,尤其当需提取RNA时。想要获得较佳结果建议使用新鲜血液。 本试剂盒适用的血液保存方法 处理保存的血液时提取步骤*做太大改动,但保存液会稀释你的血液样本。 ? PAXgene? Tubes () ? Biomatrica RNAgard? Blood System (/rnagardblood tube.php) 血液:里面有什么? 血液中含有血浆、红细胞、白细胞和血小板,它是非常*特的一种样品,因为血液中的核酸非常丰富,这座基因金矿被掩埋在各种的细胞碎片和蛋白混合物中,这些污染物会影响下游的PCR反应或测序,尤其是红细胞里的血红蛋白,它是影响DNA/RNA纯度和抑制PCR反应的主要元凶。 血液的采集和保存 应该用抗凝管采集血液,否则血液凝集并把携带DNA/RNA的细胞都包埋起来。。常见准的血液采集管会使用EDTA或柠檬酸盐抗凝。这两种物质都不会干扰下游的基因分析。肝素也能抗凝,但它容易吸附DNA,所以不推荐。 如果不能马上处理,用于DNA提取的全血可以在4度较长保存2个星期,用于RNA提取的较长不**过2个小时。如果需要保存更长时间,则要做一些特殊处理了。如果只需要DNA,你可以将血液分装成小份(250-500 μL)置于-20oC 或-80oC 长时间保存。 若要提取血液中的RNA,就需要当心了。RNA酶是一种很顽强的酶,即便在冷冻状态下仍能发挥作用,如果不能马上处理样本,我们建议将血样置于到RNA稳定液中,比如PAXgene?血液RNA管。在这些管子里头,胞RNA在18°C到25°C可稳定保存3天,2°C到8°C可保存5天。 另一方面,如果RNA中途要暂停,可把分离、裂解、冻存步骤沉淀的白细胞置于RNA酶抑制缓冲液中。例如,沉淀的白细胞可以置于PowerMag? Blood DNA/RNA Isolation kit所带的PowerMag? 白细胞裂解液中,-20oC 或 -80oC保存,当你做好提取准备时,将样品取出放在室温,照接下来的步骤操作即可。 从血液中获得DNA或RNA 在PowerMag Blood DNA/RNA Isolation kit 中,利用了哺乳动物血液中,基因组DNA(gDNA)只存在于白细胞中,红细胞和血小板中没有核酸所以不含gDNA(禽类红细胞例外)的特性,红细胞或白细胞靠缓冲液来裂解。一般来讲,1ml人血中白细胞的平均数大概7,000,000个。 操作的第一步是用低渗缓冲液选择性的裂解红细胞。然后沉淀白细胞,去除上清中含有亚铁血红素的红细胞。。往白细胞沉淀中加入裂解缓冲液以释放核酸,像上面说到的,如果要提取RNA而又不能立马处理,此处是可以将其放在(-20℃ 或-80 ℃)长期保存的时机,接下来使用ClearMag? 磁珠特异性捕获核酸,去除杂质,再洗涤核酸,最后洗脱的核酸可直接用于下游反应。 RNA和DNA的平均得率? 没有两个血液样本是一样的。白细胞数量的不同会影响到提取的核酸的量,而白细胞数量会受采样时宿主的健康状况影响。不同种属动物血液的核酸提取得率也不一样。然而,每200ml MO BIO员工全血的DNA和RNA平均提取得率分别是3mg和1mg。 高分子量的核酸 如果你要用高通量的方法从血液中提取高分子量的核酸,这款试剂盒再合适不过了!我们已经用这款试剂盒提取到了高达100kb的DNA片段,如果你在寻找那些含量不高但片段很长的靶DNA以用于测序,使用这款血液试剂盒吧! 说了这么多,实在饿了,我较好回到餐桌那去,我的水和大蒜们都在等我呢,万圣节后见! 参考文献: 1. Yokota M, Tatsumi N, Nathalang O, Yamada T, Tsuda I. (1999). "Effects of Heparin on Polymerase Chain Reaction for Blood White Cells". J. Clin. Lab. Anal. 13: 133–140. 2. DNA isolation by a rapid method from human blood samples: effects of MgCl2, EDTA, storage time, and temperature on DNA yield and quality. Lahiri DK1, Schnabel B. Biochem Genet. 1993 Aug;31(7-8):321-8.